Program virtuálne naštiepi lineárnu alebo kruhovú sekvenciu DNA jedným až tromi restrikčnými enzýmami. Fragmenty zoradí podľa veľkosti a v názve každého uvedie jeho dĺžku, polohu v pôvodnej sekvencii a enzýmy, ktoré ho vytvorili. Ako restrikčné enzýmy štiepia DNA, je vysvetlené v článku Klonovanie DNA.