Príklad č. 5

U myši Clethrionomys gapperi sú v lokuse pre transferín (krvný proteín) známe tri genotypy: MM, MJ a JJ. V populácii, ktorá bola odchytená z územia severozápadnej Kanady, bolo 24 jedincov genotypu MM, 46 jedincov genotypu MJ a 22 jedincov genotypu JJ.

1. Vypočítajte genotypové frekvencie.
2. Vypočítajte alelické frekvencie.
3. Zistite, či je daná populácia v genetickej rovnováhe.

Riešenie 1 link

Genotypové frekvencie vypočítame vydelením absolútnych hodnôt jednotlivých genotypov počtom všetkých jedincov:

p²(MM) = 24 / (24 + 46 + 22) = 24 / 92 = 0,26
2pq(MJ) = 46 / 92 = 0,5
q²(JJ) = 22 / 92 = 0,24

Riešenie 2 link

Alelické frekvencie môžeme vypočítať viacerými spôsobmi:

1. q(J) = √(q²) = √0,24 = 0,49
   p(M) = 1 - q(J) = 1 - 0,49 = 0,51
   
2. p(M) =

   2 × počet MM + počet MJ

   ---

   2 × počet všetkých jedincov

   =

   2 × 24 + 46

   ---

   2 × 92

   = 0,51
   q(J) =

   2 × počet JJ + počet MJ

   ---

   2 × počet všetkých jedincov

   =

   2 × 22 + 46

   ---

   2 × 92

   = 0,51
3. p(M) = p²(MM) + ½ × 2pq(MJ) = 0,26 + ½ × 0,5 = 0,51
   q(J) = q²(JJ) + ½ × 2pq(MJ) = 0,24 + ½ × 0,5 = 0,49

Riešenie 3 link

Testovanie H-W rovnováhy pomocou vzorca:

2pq(MJ) = 2 × √[p²(MM) × q²(JJ)]
0,5 = 2 × √(0,26 × 0,24)
0,5 = 0,5

Testovanie H-W rovnováhy pomocou Χ²-testu:

Najprv si vypočítame alelické frekvencie z absolútnych počtov genotypov:

Na základe týchto vypočítaných alelických frekvencií určíme genotypové frekvencie:

p²(MM) = 0,51² = 0,2601
2pq(MJ) = 2 × 0,51 × 0,49 = 0,4998
q²(JJ) = 0,49² = 0,2401

Vypočítané genotypové frekvencie použijeme na výpočet teoretických hodnôt (t) a porovnáme tieto hodnoty s experimentálne zistenými počtami jedincov (e). Hodnoty zapíšeme do tabuľky Χ²-testu:

t(MM) = p²(MM) × počet všetkých jedincov = 0,2601 × 92 = 23,93
e(MM) - t(MM) = 24 - 23,93 = 0,07
t(MJ) = 2pq(MJ) × 92 = 0,4998 × 92 = 45,98
t(JJ) = q²(JJ) × 92 = 0,2401 × 92 = 22,09

Analyzovaná populácia myší je v danom znaku v genetickej rovnováhe.